在4种结构蛋白质中，VP1诱导中和抗体并与抗感染免疫有关。

在口蹄疫病毒感染的细胞培养液中，有大小不同的4种粒子。

最大的粒子为完整病毒，其直径为(23±2) nm，沉降系数为146S，具有感染性和免疫原性；

第二种为不含RNA的空衣壳，其直径为21 nm，沉降系数为75S，具有良好的型特异性和免疫原性，但没有感染性；

第三种为衣壳蛋白裂解后的壳微体(亚单位)，其直径为7 nm，沉降系数为12S，无RNA，无感染性而有抗原性；

第四种为病毒感染相关抗原(VIA)，沉降系数为4.5S，是一种不具有活性的RNA聚合酶，当病毒粒子进入细胞，经细胞蛋白酶激活才具有酶活性，能诱发机体产生群特异性抗体。

口蹄疫病毒有7个血清型，即A、O、C、SAT1、SAT2和SAT3(南非1、2、3型)及Asia-I型(亚洲1型)，我国目前流行的有O、A及亚洲1型，欧洲主要是A、O型，以O型多见。

病毒具有多型性、易变异的特点，各血清型间无交叉免疫性，但在临床症状方面的表现却没有什么不同。

每一个血清型又包含若干个亚型，同型各个亚型之间也仅有部分交叉免疫性。

口蹄疫病毒易通过抗原漂移而发生变异，故常有新的亚型出现。该病毒的这种特性给口蹄疫的防控带来了一定困难。

口蹄疫病毒可用多种哺乳动物细胞系培养，如犊牛肾细胞、仔猪肾细胞、仓鼠肾细胞等，并产生细胞病变。

由于乳仓鼠肾传代细胞对口蹄疫病毒高度易感，故现在常用于单层细胞培养和深层悬浮培养以供研究或生产疫苗。

鸡胚也可以用于分离培养及致弱病毒。有些鸡胚适应毒株和雏鸡适应毒株对牛的致病力显着减弱。